Naruto: Clash of Ninja
Naruto: Clash of Ninja (uscito in Giappone con il nome di Naruto:Gekitou Ninja Taisen) è stato il primo videogioco su Naruto uscito su Gamecube ed è anche il primo titolo che sfrutta un motore grafico 3-D con un'ottima gestione del cel-shading arricchite da texture in 2-D.

Il menù di questo titolo ha 10 opzioni selezionabili:

Modalità Gioco
Modalità Multigiocatore
Modalità "VS"
Modalità Avventura
Modalità Allenamento
Modalità Storia
Time Attack
Galleria Immagini
Opzioni
Impostazioni

Per ogni modalità di gioco erano presenti 11 personaggi in totale di cui 3 nascosti, sbloccabili in seguito. La modalità con più interattività da parte del giocatore era quella denominata "Storia". I comandi principali erano intuitivi: premendo il tasto X si poteva attaccare con la "Super Mossa", la presa di ogni singolo personaggio era rappresentata dal tasto Y, per schivare un colpo si poteva premere L o R.

Naruto: Clash of Ninja 2
Naruto: Clash of Ninja 2 (uscito in Giappone con il nome di Naruto: Gekitou Ninja Taisen 2 e conosciuto in Europa come Naruto: Clash of Ninja European Version).

In questo capitolo furono migliorate le varie modalità giocatore, aggiunte nuove tecniche, abilità e personaggi. Per la prima volta furono messi a disposizione fin dall'inizio i personaggi classici (Uzumaki Naruto, Sasuke ed Sakura) in più furono aggiunte delle "evoluzioni" come quella della Volpe a Nove Code di Naruto e lo Sharingan di Sasuke. I personaggi sbloccabili erano: Kankuro, Haku, Iruka, Akamaru (cane di Kiba) e molti altri. I comandi furono pressochè invariati e fu introdotto il combattimento cooperativo dove il giocatore poteva controllare, oltre a se stesso, anche il compagno di squadra.

Naruto: Gekitou Ninja Taisen! 3
Naruto: Gekitou Ninja Taisen 3 è il terzo capitolo per Gamecube della serie "Gekitou Ninja Taisen" prodotto e distribuito nell'anno 2004 dalla Takara Tomy per Nintendo.

In questo capitolo vennero applicate migliorie grafiche, grazie anche all'inserimento di nuovi effetti di luce. Le uniche innovazioni mai trovate nei precedenti videogiochi furono il combattimento 3 contro 3 e le aggiunte dei ryo guadagnabili effettuando missioni o specifiche azioni nella modalità Avventura.

Naruto: Gekitou Ninja Taisen 4
Naruto: Gekitou Ninja Taisen 4 è l'ultimo capitolo per Gamecube. E' stato prodotto tra il 2005 e il 2006 e sempre distribuito dalla Takara Tomy.

In questo capitolo non fu presente nessuna innovazione nelle tattiche di gioco, nelle ambientazioni o nelle armi disponibili e fu considerato da molti fan come il peggior prodotto.